У 1925 році після проведення цілого циклу експериментів виявила ефект, що згодом увійшов у науку під її ім'ям - ефект Зейгарнік. В 1927 захистила диплом на основі цього свого відкриття і в 1931 повернулася в СРСР, де стала найближчою співробітницею видатного психолога Лева Семеновича Виготського. Працювала в психоневрологічній клініці Інституту експериментальної медицини, а з 1934 року працювала в НДІ психіатрії МОЗ СРСР.
Під час Великої Вітчизняної війни працювала в Чебаркулі під Челябінськом, де під керівництвом засновника нейропсихології Олександра Лурія брала активну участь у відновленні психічного здоров'я тяжко поранених бійців у шпиталі. Після війни, аж до 1967 року очолювала лабораторію психології у НДІ психіатрії МОЗ СРСР. Читала курс лекцій у МДУ імені Ломоносова. А з 1967 року вже повністю перейшла на викладацьку роботу на психологічний факультет МДУ, що недавно відкрився.
Б.В.Зейгарник є одним із творців факультету психології МДУ та лабораторії психології у НДІ психіатрії МОЗ, засновник експериментальної патопсихології. Б.В.Зейгарник написала дев'ять монографій, причому більшість їх одноосібно. 1983 року Американська психологічна асоціація присудила їй почесну Міжнародну премію імені Курта Левіна.
Ефект Зейгарник — це психологічний ефект, який у тому, що людина краще запам'ятовує перервані дії, ніж завершені. Б.В.Зейгарник вивчала цю виявлену закономірність у межах порушень мотиваційного компонента пам'яті. Дослідження у цій галузі були темою її дипломної роботи. І згодом цей ефект був пов'язаний із її ім'ям.
Феномен відтворення незавершених дій також досліджувався її вчителем - Куртом Левіним. Відповідно до його теорії поля, доступ до слідів пам'яті полегшується при збереженні напруженості, яка виникає на початку дії і не розряджається повністю при неповному його завершенні. В експериментах Курта Левіна творчу діяльність дітей переривали та пропонували їм інше заняття. Було встановлено, що у разі нереалізованості залишку потенціалу, діти за першої можливості прагнули завершити незакінчену справу. У середньому статистика показала, що незавершені дії у здорових учасників експериментів згадувалися на 90% краще, ніж завершені.